Selekcja negatywna zmniejsza zróżnicowanie populacji w przypadku mutacji powodujących zmiany aminokwasów, zwłaszcza tych szkodliwych w genach związanych z chorobami. Selekcja pozytywna zwiększa zróżnicowanie w przypadku wariantów nonsynonimicznych i wariantów w regionie 5'-UTR, co sprzyja adaptacji regionalnej. Genowe SNP wykazują nadmiernie niskie wartości F_ST z powodu selekcji negatywnej, co potwierdza się po skorygowaniu na błąd systematyczny. Szkodliwe mutacje nonsynonimiczne pozostają rzadkie we wszystkich populacjach podlegających selekcji negatywnej. SNP genowe o wysokim F_ST, zwłaszcza nienononimiczne, są nadreprezentowane 2,6-krotnie, co wskazuje na selekcję pozytywną. Ślady selekcji we wszystkich populacjach nie są specyficzne dla danego obszaru geograficznego. Gen EDAR podlegający selekcji wpływa na morfologię włosów, gruczołów potowych i zębów poprzez pleiotropię. Mutacja CR1 występująca u 85% Afrykanów, a nieobecna gdzie indziej, chroni przed malarią. Allel ochronny ENPP1 przed otyłością i cukrzycą, występujący u 90% osób spoza Afryki, praktycznie nie występuje u Afrykanów. Geny podlegające selekcji obejmują pigmentację skóry, rozwój włosów, odpowiedź immunologiczną i zespół metaboliczny. Co najmniej 60% genów o skrajnych wartościach F_ST podlega selekcji pozytywnej. Selekcja pozytywna przyczynia się do różnorodności morfologicznej, chorobowej i fenotypowej między populacjami.