Region MHC wykazał najsilniejszą szybką ewolucję w Europie epoki kamienia łupanego. MHC wykazywał nadmierny udział pochodzenia od mezolitycznych łowców-zbieraczy, mimo że w genomach z późnej epoki kamienia łupanego udział HG wynosił ogółem 20%. Pochodzenie MHC z późnego neolitu było w proporcji 50:50 między łowcami-zbieraczami a rolnikami, a nie głównie rolnikami. Selekcja zachowała lokalne europejskie warianty immunologiczne łowców-zbieraczy podczas przejścia do rolnictwa. Łowcy-zbieracze prawdopodobnie posiadali adaptacje do chorób lub patogenów specyficznych dla Europy. Różnorodność MHC pochodząca od łowców-zbieraczy wspomagała odporność na infekcje związane z rolnictwem. Neolityczni rolnicy z Bliskiego Wschodu przywieźli geny pigmentacji skóry, preferencyjnie wyselekcjonowane pod kątem witaminy D. Styl życia rolniczy zintensyfikował selekcję genów odpornościowych ze względu na bliskość zwierząt i dietę. Biorąc pod uwagę presję chorób, nie spodziewano się nadmiernego udziału przodków rolniczych w MHC. Geny odpornościowe łowców-zbieraczy były przekazywane preferencyjnie potomkom. Większa różnorodność MHC dorównywała lub przewyższała korzyści adaptacyjne. Potwierdzono wcześniejsze ustalenia dotyczące introgresji pigmentacji z Bliskiego Wschodu. Przeanalizowano starożytne DNA 677 Europejczyków z epoki kamienia łupanego. Przejście do neolitu napędzało ewolucję odporności na całym świecie. Lokalna genetyka łowców-zbieraczy łagodziła podatność rolników na choroby. Ewolucja MHC poprzedzała pojawienie się rolnictwa lub przebiegała równolegle z nim.