Starożytne mumie z Nilu, datowane na lata 2023–2797, dostarczyły DNA o niskim pokryciu, które poddano imputacji w celu fenotypowania. Pochodzenie najbliższe współczesnym mieszkańcom regionu śródziemnomorskiego i Bliskiego Wschodu, a nie współczesnym Egipcjanom. Współcześni Egipcjanie w niedawnej przeszłości ulegli dodatkowej domieszce genetycznej z Afryki Subsaharyjskiej. Starożytni Egipcjanie posiadali allel odpowiedzialny za jaśniejszą karnację. Przewidywana jasnobrązowa karnacja, ciemne oczy, ciemne włosy, brak piegów. Twarze zrekonstruowano za pomocą głównych składowych 3D na podstawie danych SNP. Schuenemann i in. potwierdzili wzrost pochodzenia subsaharyjskiego po okresie rzymskim. Imputacja zwiększyła liczbę SNP z <3% do 29–65%, mimo pokrycia wynoszącego 0,13–0,96X. Pierwsze kompleksowe fenotypowanie DNA na tak starożytnym ludzkim DNA. Techniki te pozwalają na analizę fragmentarycznych próbek starożytnych lub kryminalistycznych o masie zaledwie 10 pikogramów.