OMIM jest finansowany z dotacji NHGRI, opłat licencyjnych oraz darowizn. Zróżnicowane źródła przychodów zapewniają długoterminowe finansowanie. Strona internetowa pozostaje ogólnodostępna pomimo ponoszonych kosztów utrzymania. Specjalistyczni kuratorzy dokonują przeglądu literatury i porządkują dane. Ponad 90% kosztów operacyjnych przeznacza się na wynagrodzenia autorów naukowych posiadających tytuły MD i PhD oraz biokuratorów. Darowizny mają kluczowe znaczenie dla zapewnienia łatwego dostępu do informacji. Ada Hamosh prosi o dalsze hojne wsparcie.