Mieszkańcy Wysp Andamańskich wywodzą się z Azji. Ludność Wielkich Andamanów wykazuje podział na grupy wynikający z połączenia plemion oraz domieszkę genetyczną pochodzącą od Indian z kontynentu i mieszkańców Nikobarów. Mieszkańcy Wielkich Andamanów i Nikobarów są genetycznie odlegli, jednak linia mitochondrialna R22 występuje również u Shompenów i mieszkańców Azji Południowo-Wschodniej. Mieszkańcy Nikobarów są nosicielami haplogrupy M74b pochodzącej z Azji Południowo-Wschodniej i Wschodniej. Onge i Jarawa tworzą grupę genetycznie zbliżoną, co odpowiada powiązaniom językowym. Jarawa niedawno oddzieliła się od Onge poprzez mtDNA M31 i M32 oraz różnice autosomalne i chromosomowe Y. Mieszkańcy wysp Andamanów doświadczyli silnej dryfu genetycznego w wyniku długotrwałej izolacji i chowu wsobnego. Negrito z Wielkich Andamanów w znacznym stopniu wymieszali się z nie-Negrito z Nikobarów, zgodnie z danymi autosomalnymi i mtDNA.