Osoby spoza Afryki posiadają 2–4% DNA neandertalczyków. DNA neandertalczyków osłabia geny o znaczeniu funkcjonalnym ze względu na o 40% niższą sprawność adaptacyjną neandertalczyków. Niższa sprawność adaptacyjna neandertalczyków wyjaśnia to osłabienie bez konieczności odwoływania się do szkodliwej epistazy. Osoby spoza Afryki cierpią z powodu resztkowego obciążenia mutacyjnego neandertalczyków, które obniża sprawność fizyczną o co najmniej 0,5%. Obciążenie to zostało pominięte w debatach dotyczących obciążenia mutacyjnego u Afrykanów i osób spoza Afryki. Afrykanie nie mają domieszki neandertalczyków, dzięki czemu unikają tego kosztu sprawności fizycznej. Recesywne szkodliwe mutacje pozwalają haplotypom neandertalczyków chronić przed niedawnymi mutacjami ludzkimi. Udział domieszki neandertalczyków rośnie z czasem poprzez heterozję, jeśli mutacje są recesywne. Symulacje potwierdzają, że sprawność fizyczna neandertalczyków jest o 40% niższa niż u ludzi. Rozkład mutacji i chowu wsobnego u neandertalczyków pozwala przewidzieć obserwowane wzorce introgresji. Domieszka archaiczna utrzymuje się, ponieważ w niektórych przypadkach korzyści adaptacyjne przeważają nad obciążeniem. DNA neandertalczyków u osób spoza Afryki zwiększa ich obciążenie mutacjami w porównaniu z Afrykanami. Hybrydyzacja neandertalczyków z ludźmi pozostawiła trwałe szkodliwe obciążenie genetyczne u Eurazjatów.