Średnia różnorodność nukleotydowa wśród Afrykanów wynosi 0,115% w 50 segmentach niekodujących, czyli prawie dwukrotnie więcej niż wśród Azjatów (0,061%) i Europejczyków (0,064%). Różnorodność wśród Afrykanów przewyższa różnorodność międzygrupową w stosunku do Eurazjatów, która wynosi 0,096%. Pi autosomalne osiąga 0,105% u Afrykanów w porównaniu z 0,070% u Azjatów i 0,069% u Europejczyków. Pi związane z chromosomem X wynosi 0,088% u Afrykanów w porównaniu z 0,042% u Azjatów i 0,053% u Europejczyków. Afrykanie różnią się genetycznie bardziej między sobą niż od Eurazjatów. Różnorodność genetyczna Eurazjatów stanowi podzbiór różnorodności afrykańskiej. Dane potwierdzają model ewolucji człowieka „Out-of-Africa”. Regiony niekodujące minimalizują efekty selekcji, ujawniając historię ewolucji. Do oszacowania różnorodności wystarczy pobranie 10 próbek z każdej grupy. W badaniach pi lub SNP należy określić pochodzenie geograficzne.