Z szczątków ludu Yixi znalezionych w chińskiej prowincji Shandong, datowanych na 2000 lat temu, uzyskano sekwencje pętli D mtDNA. Różnorodność nukleotydowa Yixi odpowiada współczesnym populacjom. Współcześni Azjaci dzielą się na sześć grup promieniowania mtDNA. Yixi wykazują najsilniejsze genetyczne podobieństwo do chińskich Hanów z Tajwanu na podstawie wskaźników częstotliwości i odległości. Yixi są bliżsi Mongołom, Japończykom z kontynentu i Koreańczykom niż Ajnom lub Japończykom z Ryukyu. Yixi są mniej spokrewnieni ze starożytnymi Japończykami z okresu Jomon i Yayoi.