Afrykanie wykazują większą różnorodność genetyczną, posiadając 54 miejsca wariantowe w porównaniu z 44 u osób spoza Afryki. U osób spoza Afryki brakuje 31 unikalnych wariantów afrykańskich. Różnorodność nukleotydowa jest niemal identyczna i wynosi 0,085% u Afrykanów oraz 0,082% u osób spoza Afryki. W ewolucji populacji spoza Afryki nie odnotowano poważnego wąskiego gardła. Możliwe jest wystąpienie łagodnego wąskiego gardła ze względu na mniejszą liczbę wariantów występujących poza Afryką. Nadmiar wariantów o niskiej częstotliwości wskazuje na niedawną ekspansję populacji. Region jest selektywnie neutralny według testów statystycznych. MRCA wszystkich ludzi ma 1,29 mln lat. MRCA osób spoza Afryki ma 634 000 lat. MRCA Afrykanów ma 1,03 mln lat. Wyższa liczba dubletów u Afrykanów wskazuje na niedawne migracje afrykańskie. Mieszkańcy Oceanii mają najniższą różnorodność wynoszącą 0,057% pi. Największa różnorodność występuje między Afrykanami a Europejczykami i wynosi 0,108% pi. Tempo mutacji wynosi 1,15 × 10−9 na nukleotyd rocznie. Efektywna wielkość populacji wynosi około 10 000. Starożytna historia nawet wśród populacji pozaafrykańskich zaprzecza teorii całkowitego zastąpienia przez Afrykanów. Ewolucja człowieka jest bardziej złożona niż prosty model „Out-of-Africa”. Przepływ genów i selekcja prawdopodobnie ukształtowały współczesnych ludzi w podzielonych populacjach.