Czaszka ze Zlatého Kůňa dostarcza najstarszy zsekwencjonowany genom współczesnego człowieka z Europy, liczący ponad 45 000 lat. Zegar genetyczny oparty na długich fragmentach DNA neandertalczyków wskazuje, że jest ona co najmniej tak stara jak znalezisko z syberyjskiego Ust’Ishim, a może nawet starsza. Wywodzi się ona z wczesnej gałęzi, która oddzieliła się po wyjściu z Afryki, jeszcze przed rozdzieleniem się linii azjatyckich i europejskich. Jej populacja nie wykazuje żadnego wkładu genetycznego w późniejsze eurazjatyckie społeczności łowiecko-zbierackie ani współczesnych Europejczyków. DNA mitochondrialne umieszcza ją na niezwykle podstawowej/starej gałęzi. Datowanie radiowęglowe nie powiodło się z powodu głębokiego zanieczyszczenia klejem zwierzęcym pochodzącym z konserwacji po wykopaliskach. Pochodzenie neandertalskie na poziomie 3% z niezwykle długimi nienaruszonymi segmentami wskazuje na bliskość zdarzenia mieszania genetycznego. Żyła w czasie, gdy neandertalczycy zniknęli z Europy około 40 000 lat temu. Supererupcja ignimbrytowa z okresu kampanii 39 000 lat temu prawdopodobnie zdziesiątkowała jej grupę oraz neandertalczyków. Wcześni współcześni ludzie dotarli do Europy ponad 45 000 lat temu, ale ta fala całkowicie zanikła.