Projekt HGP pokazał, że badania naukowe ukierunkowane na praktyczne zastosowania, oparte na odkryciach i pozbawione konkretnych hipotez, przynoszą ogromne korzyści. Projekt HGP odniósł sukces jako model wielkiej nauki w dziedzinie biomedycyny. W ramach projektu zgromadzono międzynarodowe, interdyscyplinarne zespoły specjalistów z dziedziny inżynierii biologicznej i informatyki. Prace skoncentrowano w kilku głównych ośrodkach, aby osiągnąć korzyści skali. Środowisko biomedyczne, które wcześniej podchodziło sceptycznie do wielkich projektów, dzięki sukcesowi HGP zaakceptowało przedsięwzięcia naukowe na dużą skalę.